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Wenn du nur einzelne Partitionen kopierst, dann musst du anschließend natürlich noch grub installieren, denn der residiert ja außerhalb im MBR. Das hast du bestimmt bei deinen bisherigen Versuchen nicht bedacht, oder?
Die Zielpartition muss mindestens genau so groß sein wie die Quellpartition. Größer ist kein Problem. Der sogenannte MBR (MasterBootRecord) besteht übrigens im wesentlichen aus dem Bootloader und der Partitionstabelle. siehe : https://wiki.ubuntuusers.de/dd#MBR-Boot-Loader-und-Partitionstabelle-sichern